Professeur agrégée d'histoire et titulaire d'un Master 2 sur l'usage de la violence au sein de la Résistance (sous la direction d'Olivier Wieviorka), Émeline Vanthuyne a enseigné dans l'enseignement secondaire, de 2006 à 2011. En septembre 2011, elle rejoint la Fondation de la Résistance en tant que responsable des activités pédagogiques. A ce titre, elle a notamment coordonné les brochures nationales du concours national de la Résistance et de la Déportation.